其著名的十二誓願為： 一、光明普照 二、隨意成辦 三、施無盡物 四、安立大乘 五、具戒清淨 六、諸根具足 七、除病安樂 八、轉女得佛 九、安立正見 十、苦惱解脫 十一、飽食安樂 十二、美衣滿足 位其本願功德經所說：藥師八大如來為：善名稱吉祥王如來，寶月蓮花智嚴威音王如來，金色無垢寶光妙行成就如來，無憂最勝吉祥如來，法海雷音如來，法海勝慧遊戲神通如來，藥師琉璃王如來，威勝釋迦牟尼如來。 藥師佛，身如吠硫璃色具足光明，披三法衣，右手作勝施印持帶萊的藥訶子[藏音：阿如拉，意為藥王。]左手托缽，缽內貯滿能治眾生因上果上一切諸病之妙藥．甘露，相好圓滿，以金剛雙跏趺坐於蓮花月輪上。 藥師佛並有日光和月光二菩薩為左右協侍，這是表示他不分晝夜化導眾生之意，眷屬十二藥叉大將，被配當於子丑寅卯……等十二刻，以表示他的威神力無時不在守護行者。 持藥師七佛名號，及本願功德經，或禮敬供養，或持誦咒語等功德，不但可消災延壽，滅除一切災難病苦外，並有無量無邊的功德，詳見藥師本願功德經軌，當可分曉。 聖者噶魯仁波切對藥師佛修的開示如下：尚未開悟的眾生都會有各種煩惱所困擾，那些未開悟的眾生，由於心理方面有如此多的煩惱因而導致生理方面四百零四種的傳統疾病和失調，使身體受到煎熬。藥師佛願力現是消除這些煩惱，使免於受其苦。這些煩惱是引發生理疾病及失調的根本起因 ，因而導引生理上的痛苦及煎熬。故此，清除其起因，以得到效果是同樣被重視。這就是藥師佛願力的顯示。 迴向功德： ◆可避邪、消除業障。 ◆可遠離憂苦，脫離病痛。 ◆可免除一切災難苦痛。 ◆可超拔祖靈獲得延壽。 ◆可增益善果造福澤。 ◆可獲得聖德恩惠家庭。