《女神异闻录5》发生在现代的东京，玩家扮演主角因为被诬告遭到指控，转校到虚构的私立秀尽学园。 主要人物角色皆为“怪盗”，可谓将过去作品中“青少年冒险”及“社会批判”两种叙事风格融合而成。 主要角色都遭遇了不平等的对待，被剥夺了容身之处，经由机缘觉醒了“人格面具（ペルソナ，Persona）”的能力， 组成了怪盗团。他们探索由人类潜意识欲望的物理表现组成的殿堂，夺取其产生欲望的秘宝来使恶人悔改。 和以前的系列作品一样，怪盗团也是用他们心灵的物质表现——人格面具与名为“阴影（シャドウ，Shadow）”的敌人战斗。 游戏包含角色扮演、迷宫探索和社会模拟元素。