《唐璜》序曲的篇幅相对当时的歌剧序曲来较长，大约6分钟。创作手法也标新立异，莫扎特用音乐的方式勾勒出来居中完全对立的主要人物形象——严肃而古板的司令官与贪图自由享乐的唐璜，直接引用了部分剧情旋律，使得歌剧的中心思想在序曲中已经有了具体的反映.这首序曲采用奏鸣曲方式写成，其漫长的引子几乎完整地引用了歌剧终场司令官石像出现在唐璜家晚宴上的场景音乐。在引子告一段落之后，序曲进入了奏鸣曲的快板部分，也是整首作品最主要的部分。这里作曲家用简洁而富有舞蹈性的旋律塑造出了主人公唐璜复杂而又充满魅力的个性形象，音乐风格变得明快、轻松而富有活力和朝气，与先前深沉的引子形成鲜明的对比。随后的部分在调性色彩和器乐编配上显得更为丰富多彩，旋律和节奏越来越激动人心，其实这个高潮部分正预示着主人公唐璜为追求享乐生活而与那些阻碍他自由的对立者所展开的斗争。随后的再现部，唐璜的“浪子”形象重新出现，音乐随之变得清澈，不知不觉地把音乐转入歌剧的序幕。莫扎特把序曲同歌剧直接联系在一起，也是本剧的一大特色。与《后宫诱逃》类似，为了能让这首序曲独立地在音乐会上演出，莫扎特还特意为它追加了一段尾声；而其同辈作曲家安德烈也曾为该曲谱写过一个精致而复杂的结尾。