第二乐章，D小调，3/4拍。第二乐章没有高音小号参与，是直笛，双簧管，小提琴和通奏低音的“奏鸣曲”，与后世真正的奏鸣曲不同的是，这里的奏鸣曲并没有主部副部的对比，并不把这种对比的戏剧性冲突作为乐曲发展的动力来源和主线，而是在节奏不断循环往复的安宁的通奏低音之上，由直笛，双簧管和小提琴形成美妙的“三重唱”。这个乐章可以说体现了巴洛克音乐的一些重要特点，那就是一种安宁，和谐的氛围和一种含蓄，内敛的审美追求。乐曲一开头，首先出现的是通奏低音，它反复的节奏贯穿始终，旋律却在不断的运动发展。小提琴演奏主题的第一个动机，随后双簧管进入，演奏同样的动机，而小提琴则演奏第二个动机，紧接着是直笛演奏第一个动机，双簧管演奏第二个，这完全类似于赋格的结构，但是其后的发展相当自由，乐曲始终建立在同样节奏型的通奏低音的基础上，而高音部的三件乐器也一直围绕着两个动机作发展，通过旋律和音色的对比，映衬和穿插，形成种种奇妙的图景。一切都是那样的安宁，一切都已经注定，一切都因为可预知而值得相信，但是一切的一切又都是那么的奇妙，超乎我们的想象，也许这就是巴洛克时代的精神，一种我们失落了的高尚动人的信赖。